常用的药用植物有如下：

　　一、真菌门

　　散囊菌科（曲霉科）：紫红曲

　　麦角菌科：蛹草蝉花

　　肉座菌科：竹黄

　　黑木耳科：木耳、毛木耳

　　银耳科：金耳、银耳

　　齿菌科：猴头菌

　　喇叭菌科：鸡油菌、小鸡油菌

　　多孔菌科：小孢乌芝、皱盖乌芝、隐孔菌、树舌、灵芝、紫芝、热带灵芝、彩绒革盖菌、猪苓、硫黄菌、桦褶孔、桑黄、黄多孔菌、茯苓、园孢地花、鲑贝芝、裂蹄、血红栓菌、朱红菌

　　牛肝菌科：黄粉末牛肝菌

　　口蘑科：密环菌、香菰、虎皮香菰、安络小皮伞、雷丸、裂褶菌

　　鹅膏菌科：鸡枞、草菰

　　红菰科：环纹苦乳菰、白乳菰、绒白乳菰、多汁乳菰、大红菰、密褶黑菰、臭黄红菰、变色红菰、稀褶黑菰、正红菰、绿菰

　　粪绣伞科：茶新菰

　　蘑菰科：双孢蘑菰

　　鬼伞科：墨汁鬼伞

　　灰包科：头状马勃、大马勃

　　硬皮马勃科：豆包菌

　　地星科：硬皮地星

　　鬼笔科：典褶竹荪、红鬼笔

　　二、地衣门

　　石蕊科：聚生石蕊

　　脐衣科：石耳

　　松萝科：破茎松萝、长松萝

　　三、苔藓植物门

　　蛇苔科：蛇苔

　　地钱科：地钱

　　泥炭藓科：泥炭藓

　　真藓科：南大叶藓、大叶藓

　　金发藓科：大金发藓

　　四、蕨类植物门

　　石杉科：蛇足石杉、闽浙石杉

　　石松科：石子藤石松、垂穗石松、石松、地刷子石松

　　卷柏科：深绿卷柏、兖州卷柏、异穗卷柏、细叶卷柏、江南卷柏、卷柏、伏地卷柏、翠云草

　　木贼科：笔管草、节节草

　　松叶蕨科：松叶蕨

　　荫地蕨科：华东荫地蕨、荫地蕨

　　莲座蕨科：福建莲座蕨

　　紫萁科：紫萁、粗齿紫萁

　　瘤足蕨科：华东瘤足蕨、镰叶瘤足科、华中瘤足蕨

　　里白科：芒萁、里白

　　海金沙科：海金沙、小时海金沙、狭叶海金沙

　　膜蕨科：瓶蕨

　　碗蕨科：边缘鳞盖蕨

　　蚌壳蕨科：金毛狗

　　鳞始蕨科：团叶鳞始蕨、乌蕨

　　蕨科：蕨

　　凤尾蕨科：井栏边草、剑叶凤尾蕨、凤尾蕨、半边旗、蜈松草

　　中国蕨科：银粉背蕨、毛轴碎米蕨、野雉尾、栗柄金粉蕨

　　铁线蕨科：铁线蕨、扇叶铁线蕨

　　水蕨科：水蕨

　　裸子蕨科：凤丫蕨

　　车前蕨科：长柄车前蕨

　　书带蕨科：书带蕨

　　蹄盖蕨科：假蹄盖蕨、长江蹄盖蕨、单叶双盖蕨

　　金星蕨科：渐尖毛蕨、干旱毛蕨、华南毛蕨、金星蕨、延羽卵果蕨

　　铁角蕨科：厚叶铁角蕨、虎尾铁角蕨、倒挂铁角蕨、胎生铁角蕨、铁角蕨、

　　长叶铁角蕨、华中铁角蕨

　　乌毛蕨科：乌毛蕨、狗脊蕨、东方狗脊、胎生狗脊蕨、单芽狗脊蕨

　　鳞毛蕨科：刺头复叶蕨、贯众、阔鳞鳞毛蕨、绵马鳞毛蕨、黑足鳞毛蕨、镰羽贯众、齿头鳞毛蕨、黑鳞耳蕨、对马耳蕨

　　肾蕨科：肾蕨

　　骨碎补科：圆盖阴石蕨

　　燕尾蕨科：燕尾蕨

　　水龙骨科：线蕨、抱石莲、伏石蕨、扭瓦韦、粤瓦韦、瓦韦、攀援星蕨、江南星蕨、金鸡脚、水龙骨、贴生石韦、相似石韦、光石韦、盾蕨、庐山石韦、石韦

　　槲蕨科：槲蕨

　　剑蕨科：柳叶剑蕨、匙叶剑蕨

　　苹科：苹

　　槐叶苹科：槐叶苹

　　满江红科：满江红

　　五、种子植物门

　　1、裸子植物亚门

　　苏铁科：苏铁

　　银杏科：银杏

　　松科：油杉、江南油杉、马尾松、黄山松、金钱松